2025년 필독! 근로소득세 신고 시 원천징수세액 미공제 사례 5가지 집중 해부





근로소득세 신고 시 원천징수세액 미공제 사례 집중 분석


근로소득세 신고할 때 꼭 챙겨야 하는 원천징수세액. 그런데 신고서 제출 후에 ‘원천징수세액이 빠졌다?’라는 얘기를 듣는 경우가 종종 발생합니다. 이번 글에서는 근로소득세 신고 과정에서 발생하는 원천징수세액 미공제 사례를 쉽게 풀어 설명드리겠습니다. 신고 과정에서 실수 없이 제대로 세액을 반영하려면 어떤 점을 조심해야 하는지 꼼꼼히 확인해 주세요.


목차


원천징수세액과 근로소득세 신고의 기본 이해

원천징수세액은 사용자가 근로자에게 급여를 지급할 때 미리 떼어 국세청에 납부하는 세금을 말합니다. 즉, 매월 지급하는 월급에서 근로소득세 일부를 미리 떼어내는 제도입니다. 근로소득세 신고 시 이 원천징수세액은 이미 낸 세금으로 인정되어 신고 시 차감합니다.

근로소득세는 다음 두 단계로 징수됩니다.

  • 1단계: 매월 임시로 급여에서 원천징수세액 공제
  • 2단계: 다음 해에 연말정산 또는 종합소득세 신고 시 총소득과 세액을 종합하여 최종 세액 확정

이 과정에서 원천징수세액이 미공제되면 실제 납부해야 할 세금이 잘못 계산되어 불이익이 생길 수 있습니다.


주요 원천징수세액 미공제 사례 5가지

1. 일용근로자 소득에서의 원천징수 누락

일용근로자에게 급여 지급 시, 근로소득공제를 적용한 뒤 정해진 세율로 원천징수 해야 합니다. 그러나 일당이 15만원 이하 혹은 1,000원 미만 소액 원천징수세액의 경우 일부 사업장에서 누락 사례가 발생합니다.

일용근로소득도 근로소득에 해당하여 반드시 신고하지만, 법령상 1,000원 미만은 원천징수 의무가 없다는 점에서 착오가 발생하는 경우가 많습니다.

2. 근로소득 간이세액표 적용 오류

원천징수세액을 산출할 때는 간이세액표를 근거로 해야 하는데, 총급여액과 공제대상 가족 수 등에 따른 올바른 금액 산출이 어려워 잘못 적용하는 사례가 있습니다. 특히, 가족 공제 수를 잘못 기재하여 세액을 적게 원천징수하는 일이 발생합니다.

3. 상여금 분할 지급 시 원천징수세액 계산 누락

상여금을 지급 대상 기간에 따라 나누어 계산해야 하는데, 상여금 지급 시 근로소득 이외의 급여와 합산해 정당하게 원천징수하지 않아 미공제 사례가 있습니다.

4. 블로그 등 부업 소득과 근로소득 간 연계 미확인

근로소득과 별도로 발생하는 사업소득(예, 블로그 수익)이 있을 경우 합산 신고해야 하지만, 원천징수세액 공제 여부가 제대로 반영되지 않아 신고 시 누락될 수 있습니다.

5. 회사 내부 시스템 오류 및 서류 미제출

사용자 측의 원천징수 계산 시스템 오류나, 원천징수 세금 납부 증빙서류를 국세청에 제출하지 않거나 누락하는 경우, 신고상 세액이 공제되지 않는 사례가 흔하게 보고되고 있습니다.


원천징수세액 미공제 문제의 영향과 주의사항

원천징수되지 않은 세액은 신고 시 추가 납부 증가로 이어져 근로자와 사업주 모두 불이익을 당할 수 있습니다.

세금 신고 시 원천징수세액 미공제 문제는 종종 다음과 같은 문제를 초래할 수 있습니다.

  • 추가 세금 납부 요구 및 가산세 부과 위험 증가
  • 연말정산 과정에서 환급 지연 또는 반대로 세금 부족으로 인한 불편 발생
  • 근로자 신뢰 하락 및 세무조사 가능성 증대

따라서 신고 전 다음 사항을 반드시 점검하시길 권장합니다.

  • 매월 원천징수된 세액이 간이세액표에 근거해 올바르게 계산되었는지 확인
  • 일용근로자, 상여금, 블로그 부업 수입 등 소득 유형별 원천징수 규정을 정확히 숙지
  • 국세청 홈택스 등의 시스템에서 원천징수 납부 내역을 미리 조회하여 불일치 여부 점검
  • 원천징수세액 불일치가 의심될 경우, 세무 전문가나 국세청에 문의하여 사전 상담 실시